“曾,你认为用计算机完全模拟人类基因组演化需要多久才能实现?”
该干的活干完了,沃森和曾凡回到办公室闲聊,不过,他们之间的年龄差距好像不存在,在学术领域,完全能做到平等对话。
甚至很多时候,沃森都感觉跟不上这个年轻人的思路,他对业界最新知识的吸收速度可比不上曾凡,只能感叹自己老了。
“以现在的超算发展趋势,可能需要十年以上,我和我的同学古斯塔在开发一种新型计算机,如果能成功,或许三五年内就可以实现!”曾凡自信的说道。
“期待你们成功,我们实验室先预定一台,你的模拟程序对我们的研究作用太大了,原先我们的研究好像用原始方法耕种,有了计算机模拟,就相当于进入了机械化时代,希望我能看到完全破解人类基因组奥秘那一天!”沃森感慨道。
“完全模拟人类基因组演化过程应该不需要太长时间,至于破解全部奥秘,那就不好说了,三分天注定,七分靠我们努力吧!”曾凡斟酌着说道。
人类基因组工程是对一个代表性人类个体的基因组完成测序,从立项到现在花了十几年时间,破解基因组全部基因功能,再花上十几年都算是很乐观的估计了。
就算他们的超算研制成功,完成整个模拟演化过程,都不知道要用多久时间呢,根据获得的数据破解两万五千多个基因功能,那就需要更长的时间了。
更何况,不同种群,不同肤色,不同地域的人群,甚至每个人的基因都不一样,完全破解谈何容易?
“你认为会有一组基因,专门控制着人类的智力吗?为什么白种人,黄种人就比较聪明,黑种人普遍智力比较低下,有没有可能研究一种药物,提高人的智力?”沃森突然问道。
“智力是一个综合性的概念,不像身体显性特征那么明确,涉及到大脑神经元整体的连接水平,关联的基因数量肯定会更多,牵一发而动全身,即便有这样的药物,想没有任何副作用也很难,研发起来得不偿失!”曾凡认为没有必要。
“非洲那些国家以后应该很难会发展起来了,整体智力水平太低,无法接受更高层次的知识!”老头子的思维突然转换,让曾凡有点不太适应。
“就像人的事业发展和智力没有必然联系一样,国家的发展和人群的整体智力水平也没有必然联系,你的结论太过主观和片面,不敢苟同!”
“为什么?你能详细说明一下你的观点吗?”沃森显然对这种话题很感兴趣。
“你们国家是现在公认的最发达国家,你认为这个国家民众的平均智力水平是全世界最高吗?”曾凡反问道。
“当然不是,非洲裔拉低了整体水平!”
“那你的观点就不成立了!国家的发展水平既有内政治理原因,也有外部环境因素,民众的整体智力水平影响没那么大,对于个人来说,勤奋和毅力对事业的帮助更大,有时候太过聪明反而是一种阻力!”曾凡阐述自己的观点。
他的话显然对老头子有所触动,和别人探讨交流也是一种学习方式,就好像基因的变异和进化一样,族群差异越大,变异的机会越多,进化发生的概率越大,思想的碰撞也是一样的道理。
“对人类基因组来说,你认为哪方面的基因最重要?”沃森又一次转换话题。
“从我模拟程序研究的角度来说,对模拟演化作用更大的基因组序列上的关键节点基因更重要,这些基因破解后,整个基因组演化模拟进程将会快很多!”
“也就是说,基因的重要性由它在序列中的位置决定?”
“是这个意思!”
“好吧,今后我们实验室会注意收集这方面的数据,希望你的研究早日成功!”
沃森当年在剑桥大学和克里克研究基因的双螺旋结构,得到过前辈威尔金斯教授的帮助和提携,才得以发表了那篇让他们功成名就的论文,因此对于他看重的年轻人,也不吝帮助,现代科学的研究体系变得越来越复杂,早就不是靠单打独斗能完成了。
在纽约停留了十几天时间,曾凡用在和两个实验室的人员交流沟通以及解决问题的时间只有不到一半,剩下的时间都在研究他们的藏书和相关的实验数据了,算是不虚此行。
得益于发达的网络,他们实验室和加州大学的联合项目一直在正常进行,曾凡通过网络一样可以连接加州大学的超级计算机,及时解决果蝇基因功能演化模拟中遇到的问题。
弗兰克实验室和冷泉港实验室都是在曾凡的指导下建立起各自的基因功能演化模拟系统,有了直接的联系,后续再有问题都可以通过网络进行沟通,程序的问题大部分都可以远程解决,至于实验的问题,人家的经验比都他丰富的多,不需要他去指导。
用加州大学超算模拟的果蝇幼虫已经进入成蛹期,幼虫身体细胞开始溶解,新的身体在蛹内正在慢慢成形,对于他的演化程序来说,算是进程已经过半了。
现在程序模拟的是一只雌果蝇,如果成功孵化
出成虫,就能获得大部分果蝇表达基因功能,再模拟一只雄果蝇就会容易很多,后续的繁殖产卵模拟过程难度最低,只是需要的算力要求比较高。
成蛹期的果蝇看似变化不大,根据模拟中数据生成出可视化视频在显示器上显示出来,就能看到一个个不同功能的细胞在不同基因的作用下产生出来,然后仿佛建造房屋一样,慢慢的形成果蝇成虫的身体轮廓。
这个过程可比显微镜看到的更细致,还可以根据需要进行调节回放,获取更详细的数据,加州大学的超级计算机几百千瓦的总功率,模拟一只几毫米的果蝇诞生过程,时间竟然和一只真实果蝇的诞生差不多。
至于整个完成模拟的时间,那就更长了,成蛹期模拟因为各种错误中止了十几次,几乎两三天就要修改数据重新开始。
这种进展还得益于前面多位科学家果蝇实验收集的各种数据,让他们少走了很多弯路,弗兰克的冈比亚按蚊模拟进度更慢,即便是有了曾凡他们果蝇模拟获得的数据支持,仍然很不理想,估计孵化期就需要半年甚至更长时间。
从纽约回来后三个月的时间,曾凡大部分的时间都花在了这上面,眼看着又要放寒假了,终于看到了果蝇成虫破茧而出的希望。
这可不仅仅是一只昆虫这么简单,要知道果蝇一万三千多基因中,有百分之六十一的基因和人类基因同源。
八千个基因数量人类基因组的三分之一,这些都是最原始的基因,对以后模拟人类基因组功能演化的作用不可忽视,哪怕后面的研究再没有进展,把这些基因搞清楚,对以后人类一些疾病的治疗也有很大的帮助。